裴寂拜道：“殿下，皇上這樣做，實在是一片苦心啊。皇上這些年歲數漸高，精力有些不濟；而殿下卻精力過人，文武俱備，在此百業待興之際，正該大展巨集圖。老臣以為，殿下可從皇上之意，早早接位，則對天下庶民百姓即是福音。”
眾人聽後都一愣，想不到裴寂還能說出這樣一番話來。
其實裴寂說的這些話，實在是言不由衷。他的內心裡還想讓李淵掛名為皇帝，這樣李世民就多了一層顧忌。還是李淵給他說了幾句話，讓他轉變了心意。他們要出太極殿的時候，李淵見裴寂眼含熱淚，就讓其他三人先行一步，留下裴寂有話說。
殿中僅僅剩下他們兩人，裴寂哽咽道：“陛下，你怎麼能這樣做呢？老臣——老臣我實在難以接受。”
李淵走過來，輕撫裴寂之背，語重心長說道：“裴監，我們是多年的老友了。都到了眼前的這般境地，你難道還看不出事情的大小嗎？我瞭解二郎的脾性，他有能耐，今後由他來治理國家儘可放心。然二郎的猜疑心也重，我若繼續留在皇帝位置上，時間一久，不知他又做何想。既然這樣，我乾脆徹底退位，將天下全交給他好了。至於你自己，我勸你也要好自為之。你與大郎以前交往甚密，沒少替大郎說話，即使二郎今後不為難你，可他那幫如狼似虎的屬下不定會找你的什麼麻煩。記住我的話，今後是二郎的天下，我們能保一個富足安定的晚年即足矣。”
裴寂現在能這樣乖覺地回答李世民的問話，緣於李淵的這番教導。
無奈李世民堅決不同意繼位。
李淵想起了當初自己逼隋恭帝禪位時的情景，不料想今日又復昨天故事。只不過故事的主角成了自己，那邊虎視眈眈的卻是自己的親生兒子。他就將裴寂等人又叫入宮內，令他們將傳國八璽送往東宮。
朝中大臣見狀，連連上書請李世民遵從李淵的聖意；諸州官員見了京城來的詔書，他們判斷大勢，揣摩李世民的真實思想，也連連上書請求李世民早日繼位。那幾日，通往京城的驛站異常繁忙，雪片似的上表堆在李世民的案上。
這日，眾大臣齊集東宮顯德殿裡，公舉蕭瑀向李世民進言，讓他早日即位。
後面的大臣群情激昂，齊聲喊道：“請太子早日即位。”說完，他們齊刷刷地跪倒在地。
李世民急忙從案後站立起來，說道：“世民不能順了你們的心意，請起，請起，此事還要從長計議。”
這時後面有人喊道：“殿下若不答應我們，臣下就在這裡長跪不起了。”
殿內一時沉靜了下來。
良久，李世民方長舒了一聲，說道：“唉，這實在讓世民為難。你們說的也有理，父皇執意要將這千鈞重擔交給我，我若不接，愧對你們和天下百姓。好吧，我答應你們，都起來吧。”
眾人臉現喜色，慢慢站立起來。太史令傅奕跨前幾步，奏道：“殿下，臣已經看好了日子，明日即是良辰吉日，事不宜遲，請殿下明日即位。”
李世民沉吟了一會兒，然後說道：“世民不忍拂了父皇和眾大臣的心意，就按太史令所選日子即位吧。不過，有兩件事情要先說明，一者，如今國內民窮，不宜舉辦鋪張的登基儀式，明日由我率領大家祭於南郊，告於太廟，再發一道詔令頒於天下，即為登基；二者，父皇要搬出太極宮，此事萬萬不可。我今後視事的地方即在此顯德殿內，明日登基的地方也在這裡。”
李世民既然這樣說，群臣不再有異議，此後眾人分頭準備明日的登基事宜。
李世民晚間回到寢殿，長孫嘉敏已經為他備好了晚膳。
共進晚膳時，李世民瞧著長孫嘉敏那消瘦的臉龐，心疼地說道：“敏妹，你這一段時間為我擔足了心事。瞧，你比以前瘦多了。”
長孫嘉敏滿臉喜色，說道：“我擔一點心又算什麼，誰能比上你這樣日夜操勞呢？總算大事有成，不枉了一番心血。”
李世民想起舉事前夜她為眾人添酒壯行的情景，心中對她又多了一層感激，柔聲道：“敏妹，你這些年操持家務，遵循禮法，堪稱賢人。尤其難得的是，你能奉事父皇，承順父皇之妃嬪，彌縫我與大郎之闕，更有添酒壯行的男兒氣概，實為我的賢內助。明日，父皇傳位給我，今後治理天下之時，你還要幫我出一些好主意。”
長孫嘉敏心裡一沉，正色說道：“古語有云‘牝雞司晨，唯家之索’，我前段時間所以做了一些事情，蓋因你身邊人手不夠之故。如今你做了太子，明日又成了天子，則天下文臣武將皆為你所用。我為婦人，安能再談政事？不過後宮之中，我將殫精竭慮，請你放心。”
李世民聽後心裡感動，對她又加深了一層敬重。此後兩人說話，頗有默契，不再涉於政事。
長孫嘉敏忽然提起了楊瓊之妹楊琚，說道：“我這些日子細細觀察，那楊琚確實生得國色天香，且舉手投足之間中規中矩。可惜了，她若不隨四郎，就是另外一番天地。”
楊琚和李元吉已經生有一子，此次亂軍之中被人斬殺。楊琚自從被帶入天策府後，一直跟隨楊瓊居住。
李世民抬眼問道：“我這些日子太忙亂，無暇顧及。她的情緒怎麼樣？”
“她初來之時，因心傷其子，整日呆呆地坐在那裡不思茶飯。這些日子已經好了，慢慢也有了一些胃口，臉色紅潤起來。瓊妹妹還說，楊琚能有今天，還多虧你看在她的面子上有些照顧。”
“唔，這樣最好。她們姐妹相處在一起，談談說說，可以免除寂寞。敏妹，女人最好健忘，日子久了，楊琚也許會慢慢好起來，你說是嗎？”
長孫嘉敏眼含笑意，默默地盯著李世民並不言語。
次日卯時，李世民依次去南郊、宗廟祭祀，然後回到東宮顯德殿即皇帝位。李世民就在這裡頒佈了他的第一道詔令，其內容為大赦天下，關內及蒲、芮、虞、泰、陝、鼎六州免除租調二年，其餘地方給復一年。
李世民當了新皇帝，為免朝中動盪，如裴寂等大多數大臣不做調整，諸州縣官吏亦各司其職。當然，為了行事方便，對一些重要職位做了一些調整，其即位之日，即以高士廉為侍中，房玄齡為中書令，蕭瑀為尚書左僕射，長孫無忌為吏部尚書，杜如晦為兵部尚書，封德彝為尚書右僕射，顏師古、劉林甫為中書侍郎。一開始，李世民堅決讓蕭瑀任尚書令，然此職最早由李世民領之，蕭瑀也堅決不同意，群臣紛紛附和。這樣，尚書令一職因沒有人敢就任，就空了起來，主持尚書省的事務實際上由尚書左右僕射領之，即為宰相職。
李世民對此次事變有功的人員，除了厚加賞賜外，另外皆委以重要武職，秦叔寶為左衛大將軍，程咬金為右武衛大將軍，尉遲敬德為右武侯大將軍，馬三寶為右衛大將軍，段志玄為驍衛將軍，侯君集為左衛將軍，張公謹為右武侯將軍，長孫安業為右監門將軍，常何為中郎將。薛萬徹投降之後，李世民很是欣賞他的忠心與勇猛，亦授他為右領軍將軍。如此，軍中重要武職基本上由原天策府府屬把持。
登基事畢，詔令發出。李世民身穿袞冕端坐龍椅之上，他目視座下整齊恭肅的群臣，第一次感受到了皇帝的威嚴。他對群臣說道：“朕今日登基，深感天下百廢待興，望眾愛卿竭盡心力，為天下蒼生計，多思、多述治國方略。朕想起昔日天策府的學士制度，當時使朕受益不淺。歐陽愛卿、魏愛卿，朕看弘文殿內藏書不少，共有多少卷？”
歐陽詢出班答道：“回陛下，弘文殿有四部書籍計二十二萬卷。”
李世民點點頭道：“朕想在弘文殿側再闢一文學館，可稱之為弘文館，豐富其藏書，精選天下文學之士於其中，這樣，朕在聽朝之餘，可以入弘文館檢言諮學，商榷政事。玄齡，此事由你來辦。”
封德彝出班奏道：“陛下初登大寶，即慮國事，又採納群言，則我朝幸甚。老臣還想，陛下居於東宮，似嫌狹小，能否再造新宮，以顯我朝新氣象。”
李世民答道：“不好。朕初登皇位，不顧天下之水火，為了一己安樂另造新宮，豈不寒了天下人之心？封卿，這樣的話今後不可再說。”
魏徵前去山東宣慰，剛剛回到京城，待李世民的話音一落，即出班奏道：“陛下以天下蒼生為念，委實聖明。臣以為，眼前的一件大事，要比置弘文館更重要。”
“魏卿快說。”
“陛下寬赦原東宮、齊府屬下之罪，並信用我們委以官職，更派臣往山東宣慰，免除關東賦稅一年，這些都是英明之策。可有一件最緊要的事情，陛下恰恰忘了。”
群臣聽後不禁皺起眉頭，覺得魏徵的話委實刺耳。果然，李世民的眉頭微微皺了一下，問道：“朕有何不當之處，你不妨直說。”
“先太子和齊王至今身首異處，望陛下能將他們好好禮葬。臣與王大夫有表一道，請陛下御覽。”
這句話戳到了李世民的痛處，然魏徵和王珪現為諫議大夫，說這些話也是分內所當。李世民讓將其表呈上來，只見這篇上表寫得感情真切，又極富策略。李世民讀罷不禁悚然動容，立起身道：“王卿、魏卿，你們所言極是。朕這一段時間諸事忙亂，倒是忽略了此事。他們為朕的親兄弟，當禮葬至墓所。禮葬之前，可追封建成為息王，元吉為海陵王，還要定下他們的諡號。陸卿，你為淵博之大儒，可先提之。”
陸德明斟字酌句，默默思索片刻，然後小心翼翼地奏道：“《諡法》雲‘隱拂不成曰隱。不思忘愛曰剌，暴戾無親曰剌’，老臣以為，可將息王諡曰‘隱’，海陵王諡曰‘剌’。請陛下定奪。”
陸德明的提議讓李世民和群臣都很滿意，這樣先追封李建成和李元吉為王，維持了他們和李世民的兄弟名分；又加以如此諡號，則申明瞭玄武門之變的正義性，很是恰當。
李世民感激地看了一眼陸德明，覺得他為自己解決了一個很大的難題，臉上的神色依然沉重，說道：“就依陸卿之議，虞卿，擬旨吧。禮葬之日，朕當親往致祭。王卿、魏卿，此事就由你們二人負責，知會原東宮、齊府僚屬統統前往送葬。還有，可嗣趙王福為息王之後。”趙王福是李世民和楊瓊生的兒子，年方三歲。
李世民話鋒一轉，說道：“王、魏二卿今日的行為，讓朕又想起了李卿世，他當時禮葬李密，太上皇曾經多次贊其忠義。他們三人殊途同歸，都是臣子的本分，朕心甚慰，唯望眾卿亦懷忠義之心，是為人之大倫。”
魏徵和王珪伏地叩首道：“陛下心術豁達，昭如日月，臣等今後唯忠於陛下，不敢再有一絲兒疑阻。”
解決了這個難題，李世民滿意地又復坐下。這時，只見杜如晦匆匆從殿外進來，走到前列奏道：“陛下，頡利可汗帶領二十萬兵馬，突破涇州**，現在已經到了武功縣西。”
李世民大驚，他知道涇州的城防因為李藝之亂尚未修復，以致讓頡利可汗鑽了空子。他一激靈站起身來，問道：“頡利何來之速也？他**如進無人之境，沿途州縣為何沒有一點動靜？還有，李靖、李世手握重兵，為何就沒有一點動作？”
頡利可汗聽說長安內亂，遂引兵來襲，很順利地就到了武功縣西，這裡距離長安僅有二百里。這樣，李世民在他的登基之日，馬上又要面臨著突厥大軍兵臨城下的難題。