四十歲以內，專心求學，培養繼業，不問世事。四十歲以外，奮跡功名，雄飛世界，行道濟時。
蔣能在軍中忍耐一年，甚至在“誹謗交作”中也不辭職，並希望有所補救，應當說是比以前有所進步。但他最後還是辭職了，為什麼呢？這是因為他感到，他再呆在軍中也無法有什麼補救了，無能為力了。
於是在7月12日上呈去職書。上書後，他倒心境泰然了。在寄廬怡然自樂，並自語曰：“幽境高蹈，嘯歌自適。夜間月白風清，衣襟俱爽，較之在軍中有天堂地獄之分。”是日薄暮，往登鄭成功古閱操臺，仰慕其雄風不已。同時蔣準備籌辦遊歐美旅費，欲於歐美留學三年，以增長學識。8月7日，孫中山正式辭去軍政府政務總裁職務。這自然使蔣心情沉重。9月5日晚，蔣沿海濱散步，感國事而賦詩曰：“明月當空，晚潮洶洶，國事混蒙，憂思忡忡，安得乘宗愨之長風，破萬里浪以斬蛟龍。”《先總統蔣公思想言論總集》（文錄）。宗愨，字元斡，南朝宋人，官振武大將軍。少時人問其志，答曰：“願乘長風破萬里浪。”這詩很有氣魄，似仿曹操《觀滄海》。10月3日，蔣介石來到上海見孫中山，他向孫中山陳述了辭職理由之後，提出要到歐美留學三年，路費都已準備好了。這時孫中山正在進行改組中國國民黨，希望他幫助工作，不要長期遠離中國。
蔣介石雖然答應了孫中山的要求，沒有去歐美留學，但在上海住著，感到鬱鬱不樂，索然無趣，“久思漫遊日本”。於是就寫下了這則“韜光養晦以待時”的日記。
代表總理慰勞討賊軍各將領。
10月22日蔣介石到達福州，入東路討賊軍第二軍軍部工作。在此工作初期，蔣介石擬訂作戰計劃、觀察地形、慰勞傷員，幹得頗為起勁。然而，在這個部隊中還是存在有派系鬥爭的苦惱。“當時軍中的將領，界限甚深，每相排擠，凡對總理親信者，必欲去之而後快。”〔蔣介石《革命歷史的啟示和革命責任的貫徹》(1969年3月)〕
這話有些朝自己臉上貼金，“合則留，不合則去”。
以閩粵交通阻梗，後方接濟極感困難，慨然曰：“軍事以計劃、運輸、指揮三要素結合而成，漢高祖之倚重蕭何、張良，而以韓信為次也，宜也。”
此日記道出軍中確有困難，並從以往的經驗教訓中總結出軍事上的“三要素”，可謂至理名言。慨然中的“倚重蕭何、張良，而以韓信為次”雖言“宜也”，亦含對今之孫中山輕視自己的不滿情緒也。
此次討逆殺賊，復仇雪恥之責，吾當以一身任之。招疑招忌，任勞任怨。以求達乎目的而已。
看來此次決意留職大幹一番業績了。然而，沒想到才事隔三日，蔣介石就給在上海同孫中山進行改組國民黨工作的胡漢民、汪精衛等去信，說“在這個部隊中也還存在有派系計爭的苦惱”。他在信中竟提出：“十日內如毫無進步，則無可如何。”簡直是給孫中山下最後通牒了。孫中山見蔣介石信後，急回電請他無論如何不要離去，並告訴他已經派廖仲愷來福州幫助他解決困難。
附孫中山電
接函甚愕。我以回粵討賊重任託汝為與兄，無論如何困難，總須完此任務，方能釋肩，萬勿輕去，以致僨事。如有阻力，當隨時為兄解除。仲愷即來相助。孫文。皓。
附節汪兆銘來函：
介石我兄如晤：前見兄致靜江先生兩函，弟等已引為深憂。昨奉兄致展兄及弟之函，尤為繫念。兄之困難，兄即未言，弟已深知之。弟以人生做事，決無爽快乾淨之時，而兄之去留，關係於此軍之存亡者又至大，只能以忍耐堅持相勸慰。萬一兄竟撒手，則前途希望絕矣。仲兄來，必有以為兄助，弟將赴奉天，俟由奉天回時，再定行止。近日奉張專以聯結曹三為事，欲不戰而屈吳，決策如此，肯拔一毛以為我助，誠未敢必。但籌款別無他路，只可知其不可為而為之耳。北京政局轉變甚劇，仲兄當能詳之，恕不一一。此上。敬候臺安。弟兆銘謹啟。11月20日。
介石我兄惠鑑：寒函悉。事甫著手，何可捨去，成敗所關非細，故務忍耐緊持。傑病不支，展須在先生左右。今以愷決來相助，萬勿萌去志。傑。皓。11月21日。
以黃大偉因改編事與許總司令衝突，勸其暫避滬，遂伴之同回。適廖仲愷賚總理慰留手諭至閩，會見於馬尾某輪中。
廖仲凱於11月24日趕到福州，發現蔣介石已上輪船要走了。廖趕到船上，把孫中山的一封長信交給他。孫中山的信中對蔣介石說，自己不能親自到福建，才把討伐陳炯明的重任託付你，“故望兄為我而留，萬勿以無進步而去”。孫中山在信中還提到，在永豐艦上我們都堅持了，如今無論如何困難，也應留在軍中。另外，孫中山在信中還告訴蔣介石，他正在上海與蘇俄代表進行聯絡，並且“現已大得其要領”，這樣就可以實現蔣介石想到蘇俄去考察的願望。但是革命必須要有根據地，所以孫中山希望蔣介石一定要留在軍中奮鬥，奪回廣州，“庶不負先烈之犧牲，國人之期望也”。
附孫中山書
頃見兄致展堂、季新書，有“十日內如毫無進步，則無可如何”等語。籲，是何言也。吾不能親身來閩，而託兄以討賊之任，兄何能遽萌退志如此。夫天下之事，其不如人意者，固十常**，總在能堅忍耐煩，勞怨不避，乃能期於有成。若十日無進步則不願幹，則直無事可成也。就如來信云云，子蔭當來滬，此事已不成問題，則內部之大難題已得解決，則進步為有大矣。其他紛繁小故，何足介懷。縱我無進步，而敵則日日退步，如敵軍將士之日有覺悟也，敵人之團體日形瓦解也，百粵人心之恨彼日甚也，思我日深也，此即日日之無形進步也。由此以觀，我能堅持，便等進步矣。故望兄切勿稍萌退志，必期達滅陳之目的，爾後乃能成一段落。非然者，則必百事無成也。兄前有志於西圖，我近日在滬，已代兄行之矣，現已大得其要領，然其中情形之複雜，事體之麻煩，恐較之福州情形當過百十倍。此無怪吾國之志士，乘興而往彼都者，悉皆敗興而返，吾幸而得彼津樑，從此可日為接近。然根本之辦法，必在吾人稍有憑藉，乃能有所措施，若毫無所藉，則雖如吾國之青年**，與彼主義完全相同矣，亦奚能為。所以彼都人士，只有勸**之加入國民黨者，職是故也。此可知非先得憑藉不可。欲得憑藉，則非恢復廣東不可。此次廣東一復，則西南必可統一，如是便可以西南數省為我憑藉，則大有辦法矣。此次土耳其革命黨之成功者此也。故兄前志之成否，則全在福州之一著也。能即進而滅廣州之賊固善，如其不能，則保守福州而堅持，亦為一進步也。蓋有一日福州，則我有一日之憑藉，外交內應，皆可以此為背景，倘並此而無之，則我不過為一租界之亡命客耳，奚足輕重。故兄能代我在軍中多持一日，則我之信用可加多一日，故望兄為我而留，萬勿以無進步而去。兄忘卻在白鵝潭舟中之時乎，日唯睡食與望訊息而已，當時何嘗有一毫之進步，然其影響於世界者何如也。今則有我在外活動，而兄等在福州，則為我之後盾也，有此後盾，則我之計劃措施，日日有進步，或者不必待兄等之恢復廣州，我計劃已達最後之成功，亦未可知也。故兄無論如何艱苦煩勞，必當留在軍中，與我在外之奮鬥相終始，庶幾有成，外間日日之進步，非紙墨所能盡，仲愷來，當能略道一二。總之十數年來，在今日為絕好之機會，吾人當要分途奮鬥，不可一時或息，庶不負先烈之犧牲，國人之期望也。千萬識之。
抵滬，是晚奉總理急召，命議輸運手槍辦法。翌日，來甬回家。
孫中山的那封信可謂語重心長，但蔣介石還是於27日回到上海。當日，蔣介石面見孫中山。
孫中山看到蔣介石還是那個犟脾氣，再次耐心開導，勉勵他要“堅忍耐煩，勞怨不避”讓他回福建住所。蔣卻說：“……離閩回滬，面請任何工作，都不敢違命，唯望我不再回閩……”
蔣介石如此不願意到軍隊中工作，固然有派系鬥爭的苦惱和軍費拮据這方面的問題，然而更主要的原因還是蔣介石不滿意他在軍隊中的地位。孫中山雖然很重視蔣介石的才能，凡有重大軍事決策和行動，都要蔣介石參與計劃和執行，但是，孫中山卻一直沒有授蔣以實際軍權，讓他獨當一面，這是因為孫中山看出蔣介石在軍中缺乏人望，他主觀好勝，脾氣暴戾，動輒與人爭吵，上下關係弄得很僵。所以孫中山認為蔣介石做高階參謀工作較為合適。但蔣介石卻不甘心長期充當別人的副手，做一個沒有實權的高階幕僚。蔣介石是有更大**的人，他總是在努力尋找一條擴大個人權勢的道路。當前蔣介石迫切要求的，就是過問“黨中大事”。蔣介石清楚知道，只有在國民黨內取得地位，才能有所作為。因此，這次蔣介石離開福建討賊軍，到上海對孫中山提出了堅決不回軍隊中工作的要求。雖經孫中山對他再三勸慰，要求他“堅忍耐煩，勞怨不避”，他還是沒有重返福建，於11月28日回寧波家中去了。
又之滬，代擬閩中軍事報告書，並籌劃討逆第一軍改編事，迭謁總理，與胡漢民討論時局之應付。
附許崇智來電
轉介石兄：(一)臧疊電催我出兵解決泉州，已派孫(本戎)部於豔日由省開赴莆田，集中，並加派十八團合部，日內繼進，會攻泉州。另委雪竹為本軍興、永等屬前敵總指揮官。(二)接佛航冬電，常德盛已到邵武，有再向我方前進意。(三)諸事待兄辦者甚多，請即日命駕返閩，何日啟程，乞復。崇智。支。十二月四日。