薛嶽看到這種不講戰術的愚蠢打法，氣憤地說：“還追個啥！等你追下去，人家已經跑出幾十裡了，什麼也繳不到。”
這次戰鬥，由於王俊不聽葉劍英、薛嶽的意見，打了一個消耗仗，收穫並不多。參加戰鬥的官兵怨氣橫生，向蔣介石狠狠告了王俊一狀。
10月下旬，佔領武昌的任務完成後，蔣介石決定兵分三路，向孫傳芳的部隊發起總攻，總攻日期為11月1日。薛嶽所在的第一軍為總預備隊。
此時已是深秋的景象，西風吹皺贛江水面，讓人聯想起“潯陽江頭夜送客，楓葉荻花秋瑟瑟”的詩句。戰鬥打響後，各路人馬紛紛殺向敵軍，在取得馬回嶺、德安等戰役勝利後，疾馳南昌。11月4日，在蘇聯空軍的協助下，薛嶽率三團，終於打下了牛行車站。
回想第一次攻打南昌戰役時，薛嶽曾在此攻打了三天三夜，由於兵力不足，始終未能佔領牛行車站。望著硝煙瀰漫的殘垣斷壁，他不禁感慨甚多。部隊在牛行車站宿營後，他一人圍著車站四處察看，發現車站不遠處有一小廟，便信步走了進去。
雖經戰火，小廟保留還算完整。正殿處供的是關公的神像，左右為關平、周倉拱衛。
薛嶽平生敬重兩個英雄，一為岳飛，一為關羽，敬重的是他們所代表的“忠”“義”二字。他點了三支香，向關公倒身下拜，然後起身，細讀兩邊抱柱聯文：
赤面秉赤心騎赤兔追風千古常照赤日
青燈觀青史仗青龍偃月一生不愧青天
讀著聯文，他暗暗叫好，自己就要做一個像關羽那樣赤膽忠心的將領。他忙從口袋掏出一個小本子，把聯文記了下來。
11月7日，蔣介石下令第三次攻打南昌。薛嶽原以為又有一場惡戰，誰知城裡的敵軍主力早已撤走，剩下3000多名守軍堅持了一天，便不得不舉起了白旗。至此，孫傳芳在江西的敵軍大部分被殲滅，殘部向浙、閩撤退。
11月9日，蔣介石率總司令部移駐南昌。薛嶽隨一師駐守南昌。
南昌之役，費盡九牛二虎之力，付出了血的代價，蔣介石這才深感自己的嫡系部隊問題嚴重。他“痛誡”一、二師長官，責罵王柏齡、王俊“根本不是帶兵人才”，開始對一師的領導班子進行整頓，考慮物色新師長的人選。
三、挺進浙江，升任師長
武昌、南昌攻克後，北伐軍完全佔據主動地位，吳佩孚已無反攻能力，孫傳芳在江西新敗。然而，就在北伐軍節節勝利時，蔣介石的政治野心也日益膨脹，國民黨內部開始出現分裂。
1926年冬，廣州國民黨政府和國民黨中央總部決定遷都北上，以便於北伐的繼續實施。國府要人均認為遷都武漢是最佳選擇，誰想到蔣介石卻極力反對，堅持要建都於南昌，其理由謂此舉不使軍事與政治緊密結合，實際上其內心是擔慮武漢乃唐生智的勢力範圍，他無法指揮一切，由此國民黨內部產生了漢、贛隱然對立。這為以後的所謂“清黨”埋下伏筆。
在漢、贛對立愈來愈明朗的情勢下，北伐軍開始實施了東下滬、杭的軍事計劃。
此次作戰，北伐部隊分為東路軍、中路軍和西路軍。肅清東南的戰略分兩期進行，先是由東路軍單獨向浙江發動第一期攻勢，以便將敵軍吸引到滬、寧、杭三角地帶。待戰事發展到相當程度時，北伐軍再發動第二期攻勢，東路軍與中路軍齊頭並進，一舉佔領南京。
第一師屬於東路軍，東路軍總指揮是第一軍軍長何應欽。他正率部從汕頭出發，由福建那邊打過來。因此，第一師作為東路軍先頭部隊，於12月11日先期進入浙境。
然而，一師進入浙江後，碰上了敵軍最強的孟昭月部。這孟昭月是一名敢打敢拼的戰將，且實力雄厚。雙方激戰於蘭駱、桐廬一帶。第一師不敵孟昭月部，只好向常山方向退去。孟昭月催動人馬緊追。
1927年1月3日，第二十六軍、第一軍第一師作戰失利，被迫退至衢州、龍游。
衢州，地處錢塘江與浙贛路之間，是浙江通向閩、贛兩省的門戶。此時，浙江大部落入孫傳芳之手，形勢危急。東路軍入浙部隊電請總司令部迅速增援。蔣介石聞知入浙部隊大敗，十分焦急，任命白崇禧為東路軍前敵總指揮，前去指揮