大元帥令警衛軍、工團軍、農民自衛軍、飛機隊、甲車隊、兵工廠衛隊、陸軍講武學校、滇軍幹部學校學生，統歸我指揮。
令軍校第二、三隊出發廣州市，何連長芸生由省帶贛軍新兵百名回校防守。
又令駐虎門教導團第一營，聽候虎門要塞司令楊肇英指揮，該團第四連開往沙角。
電請大元帥南下平亂。
14日，孫中山命令留守廣州的警備軍、工團軍、農民自衛軍、飛機隊、鐵甲車隊、兵工廠衛隊、廣東陸軍講武學校的學生軍、滇軍幹部學校的學生軍及黃埔陸軍軍官學校的學生軍，統歸蔣介石指揮。這回可是軍權在握了，也遂了他“死守長洲，盡我職務”大展平亂巨集圖的心願。
附蔣介石電請大元帥南下平亂電曰：韶州。孫大元帥鈞鑒：各軍聯合一致解決商團，約今、明兩日內開始行動雲。昨日解送之子彈，務乞貯存一處，暫勿分給，否則臨急無所補充，困難更甚。
如逆敵反攻省城，先生可否率隊南下平亂。中正之意，必如此方有轉機也。解彈來韶之學生，何日返省，乞復。中正叩。寒戍。
晨四時，太平門、普濟橋一帶逆團，來犯警衛軍警戒地，警衛軍還槍，破柵門而入，巷戰良久，加以各軍沿途夾擊，商團先後退卻，至日晡，西關等處盡為聯軍佔領。
陳炯明得英港政府巨資，圖襲虎門。
15日晨4時，各軍同時向商團叛軍發起反攻。
在工農武裝隊伍和廣大人民積極支援下，恰如疾風掃落葉，僅僅經過幾小時的戰鬥，就把商團的叛亂全部鎮壓了。
晚，商團副團長陳恭受來乞和，願繳械贖罪，我等允其請。
西關外商店開市。
胡省長下令復通緝陳廉伯等9人。
大元帥手諭，策北伐必能成功。
商團叛亂的被鎮壓，解除了廣州革命政府的“心腹之患”。
打擊了英帝國主義、軍閥、右派勢力，使廣州這塊革命策源地得到鞏固。在這次平叛中蔣介石顯示了謀劃與指揮的才幹，也因此提高了聲譽。
附孫中山手諭
介石兄鑑：槍械運韶，既未辦到盡交汝為，而條件今又以環境變遷，無施行之必要。然則此械兄究以何用為最適宜，請詳細考慮以告我為盼。北伐志在必行，且必有大影響。
樊鍾秀所部數日前已破萬安，收降卒一團，聞敵因此已疲於奔命，大軍現尚無款出發，但兩日後必令何雪竹隊再出，以繼樊之後塵，則敵必更恐慌矣。
趙成梁要求若能得槍兩千，則無款亦必出江西，江西敵甚無鬥志，亦無鬥力，大軍一出，必得江西全省，便可補上海之失。
張靜江有電催出師江西甚力，亦云寧棄廣東，亦當為之，此可見各省同志之望，我不可不有以慰之也。
此次一出，必能成大功，可無疑義，望兄鼓勵各人速出，一由東江擊破陳逆而出福建，一出江西，則川湘各軍必爭先而出武漢，而中原可為我所有，否則無論奉直誰勝，西南必亡。
際此時能進則存，不進則亡，必然之理也。望兄萬勿河漢吾言，幸甚。孫文。
軍校第一期學生分發見習，餘施訓話。
商團叛亂平定之後，廣州的革命形勢日趨高漲，孫中山積極進行出師北伐的部署，並已有部分北伐軍進入江西、湖南兩省。8月14日黃埔軍校已開始招收第二期學生，新舊學生已達到1200名，連教職員，共計達到1560餘名。10月19日，第一期學生開始下部隊做見習軍官。
臨行前，蔣介石對實習生訓話，要求見習的學生到部隊之後，要教育士兵“我們打仗是為自己的主義來打仗的，是為全人類的生活來拼命的，是為救國救民來痛苦流血的，這樣，就是他們死了也甘願的，也不會叫冤屈的。我們訓練軍隊，切不可把兵士教成機械一樣，如外面一般軍官，把兵士看做一隻狗一樣，平時兵士的生活全不關心，兵士有沒有飯吃，有沒有衣穿，他們全不過問，只到打仗的時候，就下個命令叫他們去打”。
附蔣介石訓話節錄
好久沒有同各位講話，今天趁著大家都從野營練習回來，正好和諸位講一講本校的情形。我們學校的範圍，本是很小的，然而我們現在做的事，比較原定的計劃簡直要多至兩倍以上，所以弄到非常為難，別的不必講，單說房子就已經安置不下了。
房子寬一點，對於衛生上才適宜，自然誰都願意，然而我們現在已經不能照這樣做去。
現在我們革命黨做事，只問這件事要不要做，如果要做，無論如何困難都要去做。比方本校長的學問才力，本來不夠做本校的校長，然而此時沒有人肯來擔當這件事，所以我不得不勉強出來擔任，盡我黨員的責任。
這好比挑擔子一樣，本來只有挑五十斤力量的人，此時亦不得不勉強挑一百斤了，不問他挑得到挑不到，先挑起來再講。……現在第一總隊的學生，都已分派到各部、各隊、各團去做見習官了。
我有幾句緊要話要對大家說明，比方我們看見國家和社會**的情形，就想一下把他改造過來，然而做起來何能這樣容易。
我們做事，尤其做革命事業，絕對不可憑著青年一時的意氣去做，不然，不但事業做不成，連自己都不能在社會生存了。
我希望大家以後出去做事，偏要鑽進那**的地方去做，切不要以為我是學生，便不屑到那些**的地方去混。只要我們此志不墮，此心不死，隨便到哪個**的地方去，不會受他的傳染，而且使得他們受我們的感化，慢慢改良過來，就可以達到我們的目的。如果一味高傲，看人不起，結果只有給人家妒忌排斥，還能夠做得什麼?不過我們到**的社會里去做工作，就要留心一件事，我們的態度和方法，不妨隨時改變，而我們的主義和目的，是要始終如一的。……司務長這個職務，在外面看起來，是很粗淺的，其實不然。
他在一連人當中，比連長要重要些，所以外**隊司務長的薪水，比連附還要多些，有時候連長、連附還要對他遷就。因為做司務長的人先要有經驗，非經過多次戰鬥的人都做不來，若果司務長稍不留心，就會誤了大事，平時的飲食起居不要說歸他經手，到了戰時，司務長的職務更加重要。
前次我們演習，還有許多的困難沒有受著的，一到真正打仗的時候，司務長的本事就表現出來了，所以我們對於司務長方面的事，更要留心學習。
本來學問是無窮的，不要學了一點，以為就夠用了，我們有了這樣的心理，我們一定不會進步的。
你們要曉得軍隊裡面最巧妙的東西，就在最粗淺東西的當中。比方我們前次野營演習的時候，有一夜工兵隊沒有飯吃，這就是司務長不好的緣故，到了真正打仗的時候，一連兩三天沒有飯吃，是往往有的。
如果司務長是有經驗的，他就會曉得打算，今夜在何處宿營，前面有多少戶口，應該帶多少糧米，種種給養都預備齊齊整整，等到軍隊到，就有飯吃，這樣的司務長才不會誤事。所以見習官到了隊上，不但要服從上官，並且要敬重司務長才好……現在對於見習官的待遇，已經決定了。
在各隊或各部的見習官，都是每月發給薪金十八元，照中國的老習慣，見習官每月都是發薪金十五元，膳宿都是和排長同樣。雖然這是一種不好的習慣，然而我們也一時改變不來。……現在西南軍隊的不好，就是沒有一定的法規，以致弄到後來只知自私自利，以升官發財為本分。
現在我已草擬一篇《革命軍刑法條例》，要我們革命軍有法律可以遵守。本來現在通行的有一部陸軍刑法條例，但是我們革命軍有許多要更改的地方，所以我另外草擬這幾條刑法，現在已經呈請中央執行委員會審定，審定之後，就可以頒行了。
我這幾天起了兩種草案，一種是《新兵精神教育問答》，一種就是《刑法條例》。
各見習官還要好好的把這精神教育問答來教兵士，若是兵士不明白這種問答，便不能打仗，因為這是使他們明白我們為什麼要打仗，為什麼要拼命。如果他們明白了我們打仗是為自己主義來打仗的，是為全人類的生活來拼命的，是為救國救民來痛苦流血的，這樣就是他們死了，也甘願的，也不會叫冤屈的。
我們訓練軍隊，切不可把兵士教成機械一樣，如外面一般軍官把兵士看做一隻狗一樣，平時兵士的生活全不關心，兵士有沒有飯吃，有沒有衣穿，他們全不過問，只到打仗的時候，就下個命令叫他去打，像這樣子，就使他打了勝仗，試問你官長的心安不安呢，做人是否應該如此。……如像陳炯明這一流，當他沒有得勢的時候，對於主義說得非常堅定，到後來，不單是賣國叛黨，還要黨魁的性命，你想寒心不寒心呢?所以我們今日只好從下面做起，養成一班有知識的部下，來監督他的上官，就令他上官想要叛亂也不能了……
呈請任命王若儼為軍校軍醫部代理主任。
致答沈應時函，論防逃兵法。
附蔣介石致沈應時函
來書已悉。近得鄉人來函雲，各兵寄往家信，多言餉銀不夠，思將逃回，是不可不預防之也。夫防逃之法，第一，不可使其身邊有錢，當發餉時，當令其繳存營部代為付郵寄家，總不許其袋中過三毫之銀，故此時最要者，查其寄銀回家之通訊處也。第二，不準請假外出，即星期日亦令作別種勤務，毋使其閒暇。第三，本月餉銀均發足十元，以後如有成績者，再行酌加一兩元。
此外務須曉以大義，令明白當兵之意義，引起其在營之趣味，使知營為一大家庭。
官長待士兵，飢則食之，寒則衣之，病則醫之，無異於父兄之待子弟。
在家為良子弟者，在營即為良兵士，在國即為良國民，在黨即為良黨員。
又令其明瞭主義之究竟，如果民生主義不成，則中國人民皆成為外國人之牛馬奴隸，求死而不可得，故現在兵士為其個人及其父母子孫求幸福，所以犧牲生命與安樂，亦不能顧。更令其知團體生活之緊要與快樂，必使其團結精神，共同生死，擊滅叛逆、國賊，與對外取消不平等條約，恢復我中國國家和民族之地位，然後個人真正之幸福乃可得也。故現在只有一意拼命殺敵，斷不可存一毫逃避之心。
逃避者無志氣、無心肝，不但不能當兵，而且不能做人，吾人必須爭氣立志，殺賊復仇，方不愧為人，亦不愧為黨員及士兵。要知軍人以衛國愛民為天職，其人格在國民中最為高尚，故須犧牲一切，方不墜革命軍人之名譽。
吾輩為黨員、為軍人，即是總理之黨員與子弟，要使其能知與黨、與總理關係之密切，而不可自暴自棄，如此則或可感動兵心，團結其精神，不致逃避矣。
練兵以勤為主，耳提面命，始終不怠，必有成效之一日也。如何盼復。
軍校特別區黨部開第六區分部成立大會，以第五六隊及工兵隊組成之。
10月23日馮玉祥發動北京政變，囚曹錕，逐吳佩孚，直系大敗。如果這時以黃埔學生軍為核心，全力北上，加上樊鍾秀建國豫軍和贛、湘軍、浙江盧永祥部則兩湖可定，蘇浙皖可復，再北上河南，與馮玉祥國民軍會師，則可控制京津，威脅奉張，進而統一東北，再戈南下，削平陳炯明、唐繼堯。便可完成統一中國之大業。
但是蔣介石萬事以個人為中心，其黃埔學生軍，一兵未出，一槍未放，死守廣州不動，其影響軍心可謂大矣。使孫中山不能破釜沉舟，孤注一擲，致使各軍因有後路可通，未能抵死一戰。遂使北伐出軍未幾而終於失敗。
大元帥手諭發給朱培德機關槍。
附孫中山手諭
介石兄鑑：機關槍之數既無前預算之多，今又分配無餘，而朱益之出發確急需此利器，請於學校內撥出一枝，航空局與甲車隊兩處或撥兩枝或一枝，總共三枝，至少亦應給兩枝，以勵軍士出發之氣可也。並附相當數目之子彈。此致。即候時祉。孫文。