杜行敏道：“齊王，你就是殺了我，也一樣有人來擒你。念在我們多日共事的情分，我衷心奉勸你：你昔為陛下之子，今日已成為****，人人可誅你。你若早一點停止抵抗出門投降，也許可以撿回一條命來。”
李祐兀自嘴硬，罵道：“我不管怎麼說也是皇子，我之命運由父皇掌握。你算什麼東西，有什麼資格對我說嘴？”
杜行敏不再與李祐說話，轉而令人取來柴薪，將之堆在主殿四側。柴薪堆罷，杜行敏令人手持火把立在柴堆之側，然後對殿內喝道：“齊王，你到底出來不出來？若再不出來，我就要下令點火了！”
殿內人見外面堆起柴薪，知道他們慾火攻。此殿的四側皆用木頭、木片造起，若大火一起，不用太長時間，殿內之人勢必會被燒成灰燼。李祐此時已然慌了陣腳，他知道自己出門投降，杜行敏不敢對自己無禮，但其心中對燕氏兄弟還有一些情分，遂大聲哀求道：“杜兵曹，不要點火，我們先商量商量。我可以開門出去，然開門之後，你可以保證燕氏兄弟的性命周全嗎？”
杜行敏不假思索，當即答道：“你們只要出門投降，我保證不讓人傷了燕氏兄弟的性命。”
李祐與燕氏兄弟又在殿內悄聲商議了片刻，覺得眼前除了開門投降以外，別無他途，遂令人開啟殿門，垂頭喪氣地走了出來。
燕氏兄弟以前自恃為李祐的心腹，在齊州城內橫行不法，**人妻女，民憤極大。他們現在隨同李祐從殿內走了出來，昔日的仇人見到他們格外眼紅，一幫人撲上前對其拼命痛打。杜行敏大聲喊叫拼命制止，然此時無人聽從。驀地，只聽一聲慘叫淒厲至極，原來燕弘亮的雙目被人生生地剜了下來，其面上頓時血流如注。隨後，燕氏兄弟的悽叫聲不絕，其手臂、腿先後被人折斷，二人慘叫聲漸漸減弱，到了最後漸無聲息，竟至氣絕。
李祐觀此慘狀，嚇得臉色慘白，渾身瑟瑟發抖。他緊緊跟在杜行敏的身邊，不停地說道：“杜……杜兵曹，你說過要保我周全，望勿食言。”
杜行敏叫來數人護在李祐身邊，令人將李祐押入東廂房內嚴加看管。寬慰道：“齊王為皇子，能決定你命運的唯皇上一人。你就待在廂房裡好好琢磨詞兒吧，為入京城後謀求性命做好準備。你放心，我會令人拿好酒好食好生照顧你，不讓你受到一點委屈。”
全城人得知齊王被擒，鼓譟聲漸漸止息。此時，天已大亮，一輪紅日掛在東方天邊。
杜行敏未休息片刻，他喚人修書二道。一道書派人快馬送往長安，其中詳述了擒拿齊王的經過；第二道書送給行在途中的李世，其中詳述齊州叛亂已平，不用再大肆調派兵馬，力促李世、劉德威早入齊州，主持善後事宜。
李世得此訊息，大喜，笑對劉德威說：“看樣子齊王舉兵叛亂，是非常不得人心的。杜行敏為一小小齊府兵曹，竟然能聯絡士眾，一舉平之。如此，倒是免了我們的一番力氣。”
劉德威凝神思索道：“齊王叛亂，難成氣候，這是眾人皆明的道理。韋挺上次致書朝廷，皇上派我來查驗，從那個時候開始，我就非常納悶。齊王嬉戲，此為長在富貴叢中之富家子弟通病。然他竟然舉兵叛亂，難道不知道自己與朝廷的力量懸殊嗎？我常常這樣想，齊王敢這樣做，其中定有隱祕曲折之事！”
李世沉吟道：“皇上天縱英明，若單獨平叛，有我一人即足矣，他定是以為其中有蹊蹺之事，所以派你與我同行。嗯，齊州大事已定，沒有必要再派兵馬，我即刻發書讓九州之兵退回其境。我們抓緊趕路以早赴齊州，屆時將其隱祕好好查驗清楚。”
兩人遂帶同屬下抓緊趕路，沿途看到許多兵馬向西退卻，這樣行到齊州地面，已過了數日。他們這日到了齊州城外，那杜行敏這些日子等待他們可謂望眼欲穿，已然早早等在那裡迎候二人。杜行敏迎著二人躬身道：“二位尚書大人，下官杜行敏在此等候多時了。”
兩人同時下馬，李世上前執著杜行敏之手，說道：“杜兵曹心向朝廷，毅然舉兵平亂，這份兒功勞，實在太大。我接到你所送之書，已然解散各州之兵返歸，並又修書一道奏與皇上，其中詳述了你的功勞。”
杜行敏涕泣道：“長史韋挺、校尉韋文振等人為諫齊王，已然丟了性命。下官當時苟且偷生，與他們相比，已然落了下乘。下官感此二君之義，又想得朝廷之惠多年，因有此舉，實在不足掛齒。二位尚書大人今日來到，齊州士民已盼望多日。請二位大人速速入城，主政齊州，以孚眾望。”
劉德威關切地問道：“齊王處境現在如何？”
杜行敏答道：“齊王被擒後，下官將其鎖在齊王府西廂房，並派人侍候其飲食起居。為了防止變生不測，下官又派人將齊王府團團護衛，等閒人不許出入。”
“齊王府內的文書檔案沒有散失吧？”
“沒有。下官入得齊王府後，知道朝廷今後定要檢索府中文書，遂派人將其封存，並囑他們不得私自窺視。”
劉德威以手加額道：“好呀，杜兵曹有勇有謀，心思又縝密，實為我朝之幸。英公，我們先入城瞧瞧齊王如何？”
李世點頭答應，一行人遂上馬馳入城中。他們到了齊王府門前又復下馬，然後步入府內，一徑來到西廂房前。杜行敏令守衛開啟房門之鎖，請李世和劉德威步入房內，不許其他人入內。
李祐此時縮在牆角，他深知自己罪大，這幾日茶飯不思，臉龐日益消瘦起來，加上他還穿著那身沾有血汙的袍服，上面又裹有灰土，愈顯其狼狽無比。他與李世和劉德威相熟，現在他縮在牆角里，不發一言，用呆滯的目光瞪視著他們。
劉德威轉對杜行敏道：“杜兵曹，齊王犯有大罪，然他畢竟為皇子，其爵位未失，怎能讓他穿如此汙穢的袍服？”
杜行敏為難地答道：“下官曾讓人取來乾淨衣袍讓齊王更換，奈何齊王堅決不換，下官無法可想。”
這時，躲在牆角里的李祐發聲道：“劉德威，你不要假仁假義了。當時父皇派你來齊州查驗，你信了韋挺的一面之詞，到父皇面前說了我不少壞話，以致我到了今天的境地。哼，人之將死，再換上那些勞什子衣袍又有什麼用處？”
“皇上當時召你和韋挺回京問話，至多訓斥你一番，你不該殺了韋挺、韋文振，又舉兵為亂，事都是你做出來的，怎麼又攀到我的頭上了？”
李祐不與劉德威爭辯，扭過頭望著牆角，不再搭理他們。
李世始終未發一言，看見李祐此種狀態，嘆了一口氣，將手一揮，二人隨他走出房外。李世囑咐杜行敏道：“好好看顧齊王，我想皇上定會讓我們將他解赴京城，如此，這段日子須使齊王毫髮無損。”
杜行敏躬身答應。
此後數日，李世在杜行敏陪同下巡視齊州城防，並貼出安民告示，以恢復齊州秩序。劉德威則帶領一干人馬入齊王府內，他們檢索王府內文件，審問涉案人犯，力圖查清此次謀逆的來龍去脈。
數日後，李世民的敕旨下，其中責李祐曰：“汝素乖減德，重惑邪言，自延伊禍，以取覆滅。痛哉，何愚之甚也！為梟為獍，忘孝忘忠，擾亂齊郊，誅夷無罪。去維城之固，就積薪之危；壞盤石之基，為尋戈之釁。背禮違義，天地所不容；棄父無君，神人所共怒。往是吾子，今為國仇。”另詔李世、劉德威將李祐及一干人犯押送京城。
杜行敏因此大功被授為齊州都督，封南陽郡公，其手下參與此事者皆有封賞。
李世民感於韋挺、韋文振忠烈，擢升韋挺為齊州都督，賜爵武都郡公，諡曰敬；贈韋文振為左武衛將軍，賜爵襄陽縣公。
杜行敏以兵曹之事被授為一州都督，官至四品，可謂此次事變的最大得益者。
李世、劉德威接到李世民的詔令，即整頓行裝，帶同李祐等人奔赴長安。他們出城之時，杜行敏殷勤相送，一直將他們送出十里以外。
車仗轆轆聲中，李祐等人被囚於檻車中搖搖晃晃行到京城。李祐從此再難見父皇與母親之面，其入京城之後即被囚於殿中省，數日後，被李世民賜死。其同黨及陰弘智等四十四人，亦於同日被斬於刑場。陰夢婕受此案牽連，被廢為庶人，幽閉於深宮。
李世民將李祐賜死，其心情並不輕鬆，那日高士廉及長孫無忌在側，李世民痛心說道：“祐兒身死，還是緣於其母啊！陰氏歌妓出身，沒有什麼見識，對祐兒所教就失於敦厚。還有那陰弘智，什麼話不好說，卻勸祐兒陰養死士，如此就埋下了禍根。”
李世民將李祐之死歸咎於陰夢婕和陰弘智，實屬偏見。皇子長成後，由宮中統一安排師傅及教授，與其生母接觸不多。
長孫無忌道：“齊王自小就有劣性，後來遠離陛下身邊，失於教誨，遂有今日，委實可嘆。”
李世民嘆道：“我即位之後，除了起初的羅藝及王君廓謀反以外，十餘年來天下安之若素，我頗為自喜。不料祐兒舉兵為亂，最終扯反旗的竟是自己的親生兒子，天下之人定會笑我不會教子了。”
高士廉勸道：“龍生九種，那是勉強不來的，望陛下勿慮。”
這時，太監奏曰刑部尚書劉德威候在殿外，要求面見皇上。
“宣他進來。”李世民說道。
劉德威入殿後禮畢，李世民問道：“劉卿，齊州的這檔子事累你多勞了。如今一干人犯已然就戮，你也該歇息一陣了。瞧你神色嚴肅，莫非還有什麼事未完嗎？”
劉德威奏道：“陛下，臣將齊王府內的所有文件移來，逐件驗查，發現其中隱祕曲折之事甚多，因事體重大，微臣不敢擅專，特請陛下示下。”
李世民仰頭嘆道：“祐兒已死，此案已結，若事不大，可以放開不問了。朕多次說過要寬法慎刑，只要牽扯之人未參與謀反之事，就讓他們各安其所吧。”
劉德威躬身道：“陛下仁慈胸懷，臣心懷感激。然此事太過重大，不可不奏。臣檢索齊王府中文件……”
“文件？你曾奏齊王府記室孫處約向祐兒上諫書無數，多匡正祐兒言行。朕欣賞孫處約有魏徵之風，已然下詔重用了。”
孫處約為李祐的記室，其對李祐好嬉遊結交小人之事深為不滿，多次諫其行為。由此惹得李祐大為光火，將其逐回家中，不許再入齊府。劉德威此次檢索文書，將孫處約所上諫章集於一起供李世民御覽。李世民覽罷讚賞不已，詔授孫處約為齊州別駕，官至正五品。
“臣今日所奏非關孫處約，卻是與東宮僚屬紇幹承基有關。”劉德威打量了高士廉和長孫無忌一眼，毅然說道。
“紇幹承基又怎麼了？”
“陛下，臣檢索齊王府文書，發現東宮紇幹承基與齊王府書信來往甚多，信中語言隱晦，莫辨其意，令人難解。臣回京後，即讓人拘來紇幹承基詢問。”
“紇幹承基莫非與謀反之事有關嗎？”
“大有干係！那紇幹承基一開始口風甚緊，動輒抬出太子之名來辯駁。後來打熬不過，終於將所有陰謀之事和盤托出。”
“嗯，想是你對他動了大刑，別是屈打成招吧？”
“臣不敢。紇幹承基所招非是胡言亂語，臣細細訪查對照，發現其所言皆有憑據。”
“好吧，你可詳細道來。”
劉德威又環視高士廉和長孫無忌一眼，看得出來，其心存顧慮。
李世民有點不耐煩，斥道：“他們二人為朝中重臣，又是朕的至親，你有什麼話不用避開他們，只要你所言為實，但說無妨。”
劉德威伏地叩頭道：“陛下，紇幹承基所招，事關太子。此次齊王叛亂之前，曾與東宮密切聯絡，意圖聯手為亂。只是因為齊王叛亂很快被撲滅，太子方沒有從容出手。”
李世民、高士廉、長孫無忌聞言大驚，李世民立起身來吼道：“什麼？太子也想謀反了？別是你屈打成招，那紇幹承基胡亂攀誣太子吧？”