轟炸過後，廢墟區域再次下降一截，原有零星突起的建築殘骸在猛烈炮火中被完全削平，在也看不出有過任何一點建築痕跡。等充滿血腥、焦臭氣息的煙塵逐漸平息下去過後，整個區域沒有一個活動目標，到處都是日軍屍體碎片，斷腿、殘肢、腸腦、碎肉、以及被烤焦的破碎衣褲、旗幟滿目皆是，磚瓦、碎片、塵土夾雜著這些雜碎皆成一片暗紅。
短短分鐘，日軍第旅團以及第旅團一個半大隊全部埋葬在這片瓦礫殘櫞之中，所餘幾百與守軍近戰之零散小股鬼子，雖在鉅變之後死戰不退，也迅即在守軍反攻部隊以及餘輛裝甲戰車的聯合打擊下迅速被殲。驕傲狂進的日軍第十三師團瞬間損失近萬步戰兵力，中央門外所餘僅工、炮、輜重，以及驚魂未定的旅團一個大隊多兵力，形勢急轉而下。
守軍新編第七旅在殲滅城內日軍後，立刻向外展開，試圖乘勢完全摧毀敵第十三師團，敵工兵、輜重、炮兵、以及所餘旅團一個大隊為維護師團安全，立刻展開防禦，及至輛裝甲自日軍擴大的缺口衝出後，日軍不得不連續後退。
而此時日機發現不對，連忙放棄對炮兵部隊的搜尋轟炸，轉而支援第十三師團進行撤退，可惜，日軍剛遭鉅變，一時之間未能做好防禦準備，新編第七旅在日機展開支援時。已經殺入第十三師團陣地，與敵展開激烈混戰。
荻洲立兵雖急招進攻下關之部隊回援，但仍未能在旅猛烈的近戰火力掃射下，穩住陣腳。不得不在回援部隊趕到之前，丟下所有輜重、火炮等物資快速撤退，直至退出和平門，沿鐵路線到達丁家莊與前來回援之聯隊會和。才終於與旅拉開距離，組織防禦。旅在荻洲立兵穩住陣腳之後，敵機威脅立刻大增，不得不在隨後退守和平門，將北線戰鬥暫時結束。
隨後，吳克為打擊日軍士氣，令五旅、六旅在防守中，自中山門、光華門、通濟門向敵軍陣地拋灑傳單，讓日軍來為十三師團陣亡鬼子收屍，規定他們要打紅十字旗。50人以下，不準帶武器。日軍指揮官朝香宮鳩彥王以及松井石根已經獲悉十三師團重創之訊息，都氣急敗壞。當即命令所有師團、飛機對城內進行嚴厲之報復，不過卻在接到宣傳單後不得不陷入停頓.
雖然一直以來日軍擴張狂熱分子都在日軍中宣傳戰死地榮耀。但是為保證日軍士氣以及國內支援，此時絕大多數戰死士兵屍體都會盡量收回火化，將骨灰運往國內。吳克在此時以暫時停戰為要求。准許日軍收回陣亡屍體，一旦耗時過久，必將嚴重打擊各部因十三師團重創所帶來的瘋狂報復心理，給後繼戰鬥帶來極大隱患。
即使以凶殘冷血著稱的朝香宮鳩彥王也在一時之間陷入猶豫之中，不接受必將導致士兵反感，影響士氣，接受也將會消耗、衰竭各部隊的狂熱進攻勢頭，使南京此戰耗時過久，增加變數。猶豫不決地朝香宮鳩彥王最後將問題甩給松井石根，等待他來決定。
松井石根對此也極度頭疼，透過情報機構，他已經知道南京防禦指揮系統昨日更換，原南京政府部隊部分撤出，此時在南京守城的就是屢次讓自己大失顏面那個地方勢力。
師團、第九師團、師團、十八師團、國岐支隊以及全軍覆沒的第六師團，現在再增加個第十三師團，松井石根忽然覺得這支人數並不多的部隊竟突然就成了自己地大敵，先後已有近十幾萬部隊陷入其詭計損失慘重，而自己快速佔領南京之計劃也在其破壞下，漏洞百出，竟然在此時陷入一種困境之中。除整補之師團外，原本充足的兵力此時竟已經只有個經過連日惡戰的師團，重藤支隊以及海軍第十一艦隊被不明攻擊擋在下關之前，無法進行有效支援，方面軍持續進攻之能力極速下降。
“吳克！”
咬牙切齒一番，松井石根對此變數卻暫時有些無可奈何。
“武藤君有什麼好辦法麼？”
松井石根按了自己已經顯的有些沉重的腦門，將目光投向新任方面軍副參謀長武藤章。
“閣下！為今之計，一，同意對方意見，藉機修整部隊，等待大本營繼續調遣兵力補充，不過此舉略顯被迫，且大量傷亡公諸於眾，有損帝國軍隊之形象，也對士兵士氣打擊極大；
二，不同意對方意見，對方提出休戰，一定是想拖延時間，方便在城內加強巷戰防禦措施，同時也將方便南京政府獲得調整時間，調動兵力再次投入南京保衛戰。
據情報，徽州地區有大量淞滬戰場撤下的軍隊修整，江北浦口地區亦有南京政府精銳部隊留守，而留守在南京城內的守軍僅幾個旅而已。待其從容佈置，在調動周邊兵力牽制，我軍勢必陷入困境，即使再從華北及關東地區調動兵力，也勢必影響帝國北進策略。
故下官認為，不如將方面軍手中所有兵力全部調入南京前線，不計手段，以狂猛之攻勢在最短的時間內突破支那首府，屠盡城中守軍，懾服支那政府軍民，以獲得修整補充時間，屆時即使傷亡再大，勝利的榮耀也將使英勇的帝國士兵不再有任何怨言。”
即使在此時，武藤章依然一副能夠快速佔領南京地模樣，回答起來依舊自信非常。
“哦？武藤君請說的仔細一點！”
九點，日軍暫停火力，同意吳克建議，並指明由通濟門進入。然而隨後日軍第三師團一部派出70多人，不打旗子，架著機槍耀武揚威的自通濟門外向南京城內逼近，一副勝利者地姿態，簡直沒把旅士兵鼻子氣歪了。
“老三，小鬼子這唱的是哪一齣？”
孫定方非常疑惑，鬼子小隊如此作為不是找死麼？
“哼！死不悔改啊！這是要試探我軍，激怒我軍，看來小鬼子不想替自己人收屍！”
“那，既然是來送死地，我這就命令部隊滅了***！”
“不急，廣德地區正在由海嘉線收編的兩萬潰兵以及部分預備部隊接手佈雷，韓部兩旅兵力已經陸續調出，時間對我軍來說一分鐘都是好地，讓他們暫時囂張一下又何妨！不過日軍這樣也好，我也不想讓他們有時間去作整修補充！”
在吳克的阻止下，前線五旅以及截留下來拼湊的兩團人馬一個個都氣股股的給鬼子讓開了道，暫時讓這股鬼子進城沿指定道路奔赴中央門。
鬼子師團見派出士兵並沒有挑起戰火，未能達到司令部目的，立刻趕在第一股鬼子帶回屍體之前，又派出一支多人士兵向城內前進。可惜在此時通濟門臨時通途已經以障礙物封上，日軍除非開火，否則根本無法前進。
吳克的行為，使朝香宮鳩彥王極為頭疼，同時也越發認定城內兵力不夠，中國軍隊在故示大方。
“不行！絕對不能讓這個狡猾的吳克計謀得逞，也不能讓那些屍體此時打擊士氣！帝國需要立刻征服支那首府來鼓舞聖戰，方面軍也需要此榮譽昭耀大日本史冊。”
下定決心，朝香宮鳩彥王即令第十六師團偷襲富貴山陣地，撕下自己偽善的面紗，再次挑起戰火。
富貴山教導總隊陣地一打響，所有陣地立刻再次陷入激戰之中，此刻日軍叫囂著要進行報復，命令所有師團不顧南京有國際人士存在，一律使用毒氣彈展開第一波攻勢，猝不及防之下，富貴山教導總隊部陣地因缺少防毒面具，傷亡極大，讓吳克不得不從緊張的守城兵力中調出兩連兵力對其進行補充。
這就是讓武藤章自信之所在了。在東北、華北、以及淞滬前期戰爭中，武藤章發現中國軍隊極少注意化學防禦，從屢次俘虜計程車兵身上，他沒有發現任何防禦裝備，且實戰證明，只要“特種煙”一出，一定能收到極大戰果。此時為彌補兵力之不足，武藤章向松井石根做出的建議以搶救士兵屍體為名，對南京城大面積實行毒氣戰。
毒氣戰沒有吳克帶來多大損失，卻讓吳克非常惱怒，鬼子簡直太囂張，光天化日違背國際公約，進行化學戰，簡直就是吃定自己不能對他們怎麼樣。
“***，敢欺負老子，老子也有化學兵！一報還一報，老子今天就讓你們這些***嚐嚐什麼叫做卑鄙，命令：
各部隊狙擊士兵一律使用瘋狗彈頭，各炮兵部隊對鬼子中心區域展開毒氣還擊！”